mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGGTGATTTGCCGG GGCAAGTTCCTCTTGGCTACA GAATGCAGCCAAGGGTGATTTGCCGGCAGATATATATGAATATTCATAGAGATGCATGTGTCGGCAAGTTCCTCTTGGCTACATT 3 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR169_2 7e-42 mtr-MIR169k 4e-43 -40 .((((.(((((((((..(((((((((((.((((.(((((....)))))...))..)).)))))))))))..))))))))).)))) (-40.00)