mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAGGATGGCTTGCCGG AGCGGGCCATCTTGTCTCACA GAAGGTAGAGAGAGTGGATTTGAGCCAGGATGGCTTGCCGGCATGCATTTTAGGGTGTTGCTAGCGGGCCATCTTGTCTCACATTTGCTATCTTTCCTCT 3 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR169_2 1e-40 mtr-MIR169q 0.0000000003 -51.3 ..(((.(((((.((..(((.((((.(((((((((((((..(((.(((((....))))))))..))))))))))))).)))).)))..)).)))))))).. (-51.30)