mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGCGTCAATATC TATTGGCGCGCCTCAATTTGA AGCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTGAATACATGGCTATAAAAATGCATCATATCAGCCATGTAGTTTGATTGAGCCGCGTCAATATCTTGTT 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase MIR171_1 3e-47 vvi-MIR171b 0.00000002 -47 (((((((((((((((((.(((((((....((((((((((((...........))).)))))))))....))))))).))))))))))))))))) (-47.00)