mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATT TATTGGCTTGGTTCACTCAGA ATTGAGATATTGGCTTGGTTCACTCAGAAGAAACAAAAAATAACACTACTTGTGAATGTTTTGATTTTGATTTTGATTTTGATTGAGCCGTGCCAATATTTCAAA 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase MIR171_1 1e-25 mtr-MIR171g 0.00002 -36.7 .(((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((.....(((.....)))....))))).))))........)))))).))))))).))))))))))))). (-36.70)