mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCCATCCCTTTGGATT AACTGCAACTTGAGGAGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTATAATATTTCAACTTTAGTCACTTTAATTTTCTCTCATATAATACTTAATTGGGATCATGCCATCCCTTTGGATTTCTCCTTTAGTAGCTAC 1 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 tcc-MIR393a 0.00000000003 -48.99 ....((.(((.(((((((.((((((((((((.((((.(((((((.................................................))))))))))).)))))))))))).))))))).))).))... (-48.99)