mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCTATCCCTTTGGATT AGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAAATCTAATTAAGTCCCTAGCTACTTAATTAACAACTTAATTTCCTTAATATCTCATAATATTTGGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCAT 1 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 gma-MIR393 0.000000000006 -43.7 .((.((((((((((((.((((.((((((((((.(((((((((........))))))))).....((((.....))))...........)))))))))))))).)))))))))))))).. (-43.70)