mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTATTTGGGGGAACTC GTTCCTCTGAATGCTTCAAAC TACTTGTTGATTTTCTCTTGGAGTTCCTCTGAATGCTTCAAACATGAGACAATCTTGATAGAAATTATGGATAGTTCTTGTTCAATGAAGTATTTGGGGGAACTCTTGGAATTGAATCAACATA 3 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-395 1e-53 mtr-MIR395j 5e-19 -49.8 ....(((((((((..(((.((((((((((..(((((((((((((.(((.(.((((((((....)))).)))).)))).))))...)))))))))..)))))))))).)))...))))))))).. (-49.80)