mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCTTTGAACGCTTCATGC GAGTTCCTTTGAACGCTTCATGCATGAGAATATCTATCTATTTGGTCTAAAATCCATTAGAAAAGATAGTTCTTCTTAAATGAAGTGTTTGGGGGAACTC 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-395 1e-43 mtr-MIR395e 8e-45 -43.1 (((((((((..((((((((((...((((((...((((((......(((((......)))))..))))))...)))))).))))))))))..))))))))) (-43.10)