mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCTTTGAACGCTTCATGC GAGTTCCTTTGAACGCTTCATGCATGAGAATATCTATCTATTTGGTCTAAAGTCCATTAGAAAAGATAGCCATTTTTTCAATGAAGTGTTTGGGGGAACTC 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-395 2e-51 mtr-MIR395r 1e-52 -41.4 (((((((((..((((((((((....((((((..((((((...(((.(....).))).......))))))..))))))...))))))))))..))))))))) (-41.40)