mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTGCATCCTGAGGTTTA AGCCTTGGAGTGCAGATTATC ATATTGAGTTTGGATAGGATAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAATAACAGCTGCGTAATTGTATCTAAGCCTTGGAGTGCAGATTATCTCTTCCTTAACACCAATGG 4 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2111c 4e-31 -44.7 .(((((.(((.(((..((((((((((((..(..(((((((((...((((........)))).)))))))))..)..))))))))))))..)))..)))..))))). (-44.70)