mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTACCGATTCCACCCATTCCTA GGATATGGGAGGATCGGTAAAA AGAGAGAGAAAGGGAAAGGGTGAAAGAGCTTGAGGAAGTTATGGGATATGGGAGGATCGGTAAAACAGATCTAATTCATCTGAATTGAATAATTTCTTTACCGATTCCACCCATTCCTATTATTTCCTTTTGTTCCTCTCTTTCCACTCTCCTCTCCAT 1 2 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 pvu-MIR2118 0.000000000000009 -68.6 .(((((.((.((((((((((.(...((((..((((((((.((((((.(((((.((((((((((..(((((.......)))))....(((....))).))))))).))).))))))))))).))))))))..))))).)))))))).)).)))))))... (-68.60)