mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGACATTTAGTGATGATGT ATCAGCATTAAATGTCACGGG TTTTCTGATTTTATGGTCCCCATGACATTTAGTGATGATGTGTCTGTTTTTTTATCAATTAATGTGTGCCACATGTGTAATTCCATTTTTTAAAAAATAAAAAAAATGGTATTTTTCAGATTTCCAGCACTAAATTCTATTGTTGGTCACGTGCCTCCTTCTCTCAAAATCTGAAAAATACCATTTTTTTATTTTTTTTAAAAATAAAATTACACACGTGGCACACATTAATTGATAAAAAACAGACACATCAGCATTAAATGTCACGGGGACCATAAAATCAGAAAGG 2 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2646b 2e-60 -156.85 (((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((....(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.((.....)).))))))....................))))))))))))))))))))))))...)))))))))))...))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))). (-156.85)