mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGCAGGGTGCATAAGGATT TTCAATTGCACCCTGCTGGA TGTTTTCAATTGCACCCTGCTGGATCAAAGAAAACCATTAAGTACATCTAATGATTTTGGAGTACAACTCACAGAAACCATTTCCACTGCAAAATGGTTTTAGAGTCCAACTCACAAAAACTATTTTCACTGCAAAATAGTTTTGGCATAATGGGCTGGGATTTATGCAGGGTGCATAAGGATTCC 5 1 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2652a 3e-21 -61.5 .(..(((...((((((((((((((((..((....((((((.((((.(((((.....))))))))).((((...((((((((((........)))))))))).))))..........(((((((((((......)))))))))))....)))))).))..)))))).))))))))))...)))..). (-61.50)