mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACGCTGCTGTGAACATGAT TATTTGACTGTCAGCGACGTC CGACAACCCTCTTCCAAATCACGCTGCTGTGAACATGATTGAGGTATATGAGGAAGCTCCCGGACTTGACGTCCGTAATGTTACAACTCCTCTGGTGCCACTACACATCAAGTTATGCCAAGCCTCTCTGTTTGACCATGATCATGCCAATTGCCAAGAATGATTCTGTAATCCTTTGGGTTGCTGCGTTGTTTAAAATGACATCCAGAGCTTGATGAACAACAATTATTTGACTGTCAGCGACGTCTGTGTGATTGTGCCAGTCT 5 2 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2653c 1e-150 -66.1 .....................((((((.((.((.(((((((.(((((..((((((((...(((((.....)))))....))).....)))))..)))))......(((((((((.((.(((((......)))))...(((.((((((.....))...(((..((.(.(((((((...))))))).).))..)))...))))))).)).))))))))).....))))))))).)).).)))))..(.(((.((......))))).). (-66.10)