mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTTTAGGTCCCTTAACTTTA AAGTTAAGGGACCTAAACGCA CCCATAAGTAATGAACTGTCCGTTTAGGTCCCTTAACTTTATTTAAAGTATCGGTTTGATCCTTTCTGTTAATTTAATTCAAAAAAACGTTAACTTTAGGGACCAAACTAATACTAATTAAATAAGATAAGGGACCAAAATTTAACATTTTTTTGAATTAAATTAACAGAAAGGACCAAACTGATACTTTCAATAAAGTTAAGGGACCTAAACGCACCTTTTATTACTTATGAGA 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2655o 2e-106 -118.37 ..(((((((((((((..((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.((..((..........................))..)).))).))))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))).))..)))))))))))))... (-118.37)