mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGTTGCATAATCGAGTTGG GTAATTGTTTATACAAACTATG ACATGCATATAAGAGGTCTAAGTTGCATAATCGAGTTGGAGTCACATTTGTCGAGTCAAGGATGTTTAAGTTGATAAGTTGTGAAGTTGTAATTGTTTATACAAACTATGATTGAAGTGCTAAATGA 6 2 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2656b 1e-56 -21.9 ....((((.(....((((..((((..((((.(((..(((..(((((((((((((.(.(((....))).).)))))))).)))))..)))...))).))))...))))..)))).).))))....... (-21.90)