mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCATGCATA ATATTATATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGCCCACCGGTTCTTCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCACA 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-160 3e-35 ptc-MIR160b 7e-42 -51.9 .......((((((.(((((((..((((((((((..(.(((.(((.(((....))).))).))).)..))))))))))..))))))).))))))..... (-51.90)