mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCTGTCTTCCTCATC GTGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCACTACTAACTCATGCACACAGAGAGGGAGACGCATTTCTTGCTGGAGTTACGAGTTACGACTCTTACCTACTATTGATTTTGTTAGCTCCAGTGAGTTAGTTATTCATGTGCCTGTCTTCCTCATCATGATC 6 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR164 4e-79 ptc-MIR164e 3e-42 -57.7 .....((.((((..((((..(((((((((....((((((((........(((((((....).).))))).((((((((((.((((....)))).......(....).......))))))))))))))))))....)))))))))..))))..)))).))... (-57.70)