mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCTGTCTTCCCCATC GTGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATGCACACAGAGTGAGAGAGACATTTCTTGCTGGAGTTATGACTCTTACCTACTATAGATTGTGTTGGCTTCAGCGAGTTAGTTCTTCATGTGCCTGTCTTCCCCATCATGATC 5 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR164 2e-83 ptc-MIR164b 3e-42 -55.5 .....((.(((((.((((..(((((((((....((((((((.............((((((....))))))((((((((((..(((((..........)))..))..))))))))))))))))))....)))))))))..)))).))))).))... (-55.50)