mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGGCTGGCTCGAAG CGTGAGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAAGCTTAAGCAAAGAGTTTTCTCTCAAGAAACAACTGTTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCAAT 5 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-166 2e-48 ptc-MIR166f 2e-39 -52.3 ..((.(((((((((((((..(.((((..((((((((.((((....(((((.......)))))...)))).))))))))..)))).)..))))))))))))))).. (-52.30)