mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGGCTGGCTCGAAG GGTGTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAAGCTTAAGCAAAGAGTTTCCTAACATGAAACAACTGTTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAACATA 5 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-166 3e-38 ptc-MIR166d 2e-39 -53.1 .((((.((((((((((((..(.((((..((((((((.((((....(((((.......)))))...)))).))))))))..)))).)..)))))))))))))))). (-53.10)