mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGAGTGAAGGGAGCTCTC GAGCTCCTTTACGCTCCAGTTC GGGTTTATGGGAGCTCCTTTACGCTCCAGTTCTGAAAGGAGATGATGGTATCCACAGCTGCTGGTTCATGAGTACCTATGGCTGCACAATATATATAGCAATGTTGTGTGCAAACTATGGGTGTGCATGACCTCGGAGAAGTGGTTGCCTTGATCTTTCTGGCCTTGGAGTGAAGGGAGCTCTCATAACCCTTC 1 1 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR159 2e-106 vvi-MIR159b 3e-24 -93.2 (((((.((((((((((((((.((((((((..((..(((((......((((.((((..((.(.(((.((((..(((((((((.((((((..((((......))))..))))))..)))))))))..)))))))..).))..)))).))))....)))))..))..)))))))))))))))))))))))))))... (-93.20)