mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGAGTGAAGGGAGCTCTC GAGCTTCTTTACACTCCAGAAC GGGCTTGTGGGAGCTTCTTTACACTCCAGAACTGAAAGGAGATACTACTGCTGGTTCATGAAAACCTATGGCTGCATTCTCTATACTGAAATTTTGTATACAAACTATGGGTTTGCATGAACTTGGAGAAGTGTTTGCTTTTATCTTTTCTGGCCTTGGAGTGAAGGGAGCTCTCATAACCGATC 1 1 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR159 4e-101 vvi-MIR159a 3e-24 -75.2 .((.((((((((((((((((.((((((((...((((((.(((((((.((.(.((((((((.((((((((((.....(((........)))..((((....)))))))))))))).)))))))).).)).))))))).)))))).(......)...)))))))))))))))))))))))))).... (-75.20)