mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGAATGCCATC TGGCATCAGAGGAGTCATGCAGG GGGGTTGATCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAAGAAGCTTGTCAAGGTTGTTGACTCTCTTCCTAGTTGGCATCAGAGGAGTCATGCAGGCCCCAACATT 2 2 5' arm Vitis_vinifera mirbase mir-160 0.00000000002 aqc-MIR160a 4e-22 -52.3 (((((....((((.(((((((((((.(((((.(((.((((...(((((.....)))))...)))).))).))))))))).))))))).)))))))))...... (-52.30)