mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCGAGGAGCCAAGCATA AAATGGGTTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACGTAGAGACCACTCCCTTTCCCGGATTGGCTATTTGCGGGTGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATACCCACCATTC 2 0 5' arm Vitis_vinifera mirbase mir-160 9e-45 rco-MIR160b 9e-17 -58.3 ...(((((.((((.(((((((.((((((((((.((((((..(((.(((.......))).)))...)))))).)))))))))).))))))).)))))))))...... (-58.30)