mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCACCTTGGCTAATT GTCTTGTCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGCCCTATCCCAAGTGGGTCAATTTCTTTCTTTTTTCCAAGTAGTGTTTGATATTTGATATATCATGAATCCGGTTGTTTGGGTTCCAGGCAGTCACCTTGGCTAATTTTACAGGCTCT 1 3 5' arm Vitis_vinifera mirbase MIR169_5 9e-80 ptc-MIR169l 0.000000008 -49.9 ((((.((..(((((((((((.(((((.(((((.((((...(((.(((((((....((..(((......))).))....((((((.....)))))))).))))).)))..))))...)))))))))))))))))).)))..))))))... (-49.90)