mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTCAAGGATGACTTGCCG GCAAGTTGACTTGACTCTGT AGGGTGGAATTGAGTCAAGGATGACTTGCCGTTATATATTTGCAGAAGGGCACGCAGGGGCCTTTAGCTATGTGTTACCGGCAAGTTGACTTGACTCTGTTTGGCCCTCT 3 1 5' arm Vitis_vinifera mirbase MIR169_2 1e-56 vvi-MIR169r 3e-41 -52.8 (((((.((((.((((((((...(((((((((..((((((..((.(((((.(.......).))))).)).))))))...)))))))))..)))))))).)))).))))).. (-52.80)