mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGCGCCAATATCACT CGATGTTGGTGAGGTTCAATC TTGAAGAAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGATTGATTTATGCTTGAATGTAAAAACTGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTTCTGTGGC 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR171_1 2e-51 ptc-MIR171d 2e-21 -45.9 .....(((((.((((((((((.((((((((((((.((((..(((.(((......))).)))..)))))))))))))))).)))))))))).)))))....... (-45.90)