mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAG GGAGCATCATCAAGATTCACA GTTTGCGGATGGAGCATCATCAAGATTCACAAGTATTGAGACTCAGTGCGTGGTGGTGATGGTGACTTTTGTGGTCCCTTCCTACACTCCGATGGCTCTTTGATGTGGGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATAAA 3 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase mir-172 3e-73 ptc-MIR172g 0.0000000000001 -57.9 ..((((.(.((.((((((((((((((((.((.((...((((..((...((..(((..((.((.((((.....)))))).))...)))..)).))..))))..)).)).)))))))))))))))).)).).)))).... (-57.90)