mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT GGAGCTCTCTTTAGTCCAGTC TGTGGAAGAAGGAGCTCTCTTTAGTCCAGTCCGAGACAGCTTCAAGGCTGATACGTGGCTGCTGACTCGTTGCTTCAAGAACTCATCACATAGGCCTGGAAAAGATGGATGGTTTTTTGATCCAACGATGCAGGAGCTGCGTTCAGTTATGGCTGTCACGTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTGTATTCCACA 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR159 2e-106 rco-MIR319b 3e-24 -102.82 .((((((...(((((((((((((((((((..((.(((((((....((((((.(((..(((.(((..((((((..(((((((..((((.(((.............)))))))..)))))))..))))))..))).)))..)))))))))..))))))).))..)))))))))))))))))))......)))))). (-102.82)