mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT AGAGCTTCCTTCAGTCCACTC AGTGGTTTAAGAGAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGATGGGTTAGGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGAATGGAAATGGAGTTTACTACTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGGTAAATTTCATCCTTTTCTTGTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTCTACTGTTTT 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR159 6e-106 ptc-MIR319c 1e-48 -88.7 (((((...(((.(((((((((((((((((..((((((..((..((((((..((.(((.((.(((..((((((((.((..((((((((....(((......))).))))))))..)).))))))))..))).)).))).))..))))))..))..))))))..))))))))))))))))).))))))))..... (-88.70)