mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCA AGAGCTCCTTTTAGTCCAATA GAACAGCTGAAGAGCTCCTTTTAGTCCAATAAAGAGGGCTGAGGGGCGGCCAGAGCTGCCATCTCATGCACTTGGCTATGCTTATTCTTTTCTCAATCAATTCGGTTCGAGTATGGCTGTGGAGTGACAAATGCTAAGTTTAGCCTGATGCATGACATGGGAGCAACTCCTCCGCACGCTTTGCCCACTCATTGGACTGAAGGGAGCTCCCAGGGCAGATCT 3 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR159 4e-123 ptc-MIR319h 2e-16 -96 .....(((...(((((((((((((((((((..((.((((.(((.(((((..((.(((.((((.(((((((...(((((.(((((.((.((((.((..(((((((...))))).))..)).)))).)).......))))).)))))...))))))).)))).)))..))...)))).).))).)))).)).)))))))))))))))))))....)))...... (-96.00)