mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAACGAGAGAGAGCACGC GTGCTCTCTCTCGCTGTCATA TGTAATTGCTTGACAACGAGAGAGAGCACGCTAGTCAGCATTCATGCGAGGAACATGACTGTGTACAGGCGTGCTCTCTCTCGCTGTCATACAATCTTCTC 1 0 5' arm Vitis_vinifera mirbase MIR535 1e-34 vvi-MIR535a 1e-52 -51.4 ....((((..(((((.((((((((((((((((.((..(((.(((((.......))))).)))..)).)))))))))))))))).)))))..))))...... (-51.40)