mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTGCTCAAATGAGTATTCCA AGATGCTCATTTGAGGAAGCAA TATAAAGTTTCTTGCTCAAATGAGTATTCCAAACAACAGCTTGTGAAGCAATGATTACTGTCATAGTCTCTGCATGTGGATTGTTGTTGAGATGCTCATTTGAGGAAGCAACCTTAAAAATG 4 0 5' arm Vitis_vinifera mirbase MIR828 8e-55 vvi-MIR828b 0.00009 -42.2 ..(((.(((.(((.(((((((((((((..(((.(((((((((((((..(.(((((....))))).)..)).)))...)).)))))))))..))))))))))))).))).))).)))...... (-42.20)