mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCTCTGATACCAATTGATG TTTTGGTTGTCTGAGTTTCA CAATTATGTGTTTTGGTTGTCTGAGTTTCATGTTGGCAATTTCTTAATGATTAAACATGAGGCTCTGATACCAATTGATGCATAAACCAT 1 3 3' arm Vitis_vinifera mirbase 100 ath-MIR845a 0.00007 -30.3 ...((((((((((((((.(((.((((((((((((...((((.......)))).)))))))))))).))))))))..)))))))))..... (-30.30)