mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCTGATACCAATTGATG TTAATTATCCCTAGGGCCATG ATAACCAACATTAATTATCCCTAGGGCCATGGGATAAACAAAAACTCTGCAAAACCAAGTTAGCACACCCTAGAATGGTTCTAGCACAATTACTAACCTATGGCTCTGATACCAATTGATGGGAAAAACCT 5 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR845_2 3e-45 vvi-MIR845e 5e-53 -32.25 ....((..((((((((.....((((((((((((..............(((..(((((..((((......))))..)))))...)))..........)))))))))))).....))))))))))........ (-32.25)