mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCGTTAGATCGAGAAATGGACGT GTTCGTTTCTGGATCCAACGGTAG GGAAACTTGAAAACTACCGTTAGATCGAGAAATGGACGTCCGAGATTCGTCCACGTCACCATGAGTTAAAATTTAACTCGCAGATTCACTCCTGAGTTAAACTTTTACTGGGAGTTAAATTTTAACTCATGGTGACGTGGGCGAATCTCGAACGTTCGTTTCTGGATCCAACGGTAGTTTCCAAGTTTCC 2 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR811 4e-104 osa-MIR811a 9e-77 -128.1 (((((((((.(((((((((((.((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((....)))))..........))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).)))).))))))))))).))))))))) (-128.10)