mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCGTTAGATCGAGAAATGGACGT GTCTATTTCTCGATCCAACGGT ACCGTTAGATCGAGAAATGGACGTTCGAGATTCGTCCACGTCACCATGAGTTAAAATTTAACTCTCAGTAAATTTTAACTCATGAGTGAATCTGCGAGTTAAATTTTAACTCAGGGTGACGTGGACGAATCTCGGACGTCTATTTCTCGATCCAACGGT 1 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR811 2e-71 osa-MIR811a 1e-57 -111 ((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((...((((........))))....))).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))) (-111.00)