mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACGGACGGTTAAACGTTGGAC CCAACATTTGATCATCTGCCTT CGTATCCAACATTTGATCATCTGCCTTATTCGAAAAATTTATAAAAAAAAACAAGTCACGCATAAAGTATTATTCATGTTTTATCATATAAGAACAATAAAAATACTAATCATAAAAAAAGTAAATAAGACGGACGGTTAAACGTTGGACACG 4 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR812 2e-53 osa-MIR812b 2e-24 -30.94 (((.((((((.(((((((.((((.((((((.......(((((............(.....)....((((((.((..((((((........))))))..)).))))))....))))).......)))))).)))).))))))).)))))).))) (-30.94)