mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACGGACGGTTAAACGTTGGAC CCAACTTTGACCGTCCGTCTT GTTTTAGTGCCCAACTTTGACCGTCCGTCTTATTTGAAAATTTTTTTATTACTATTTTTATTGTTATTAGATGATAAAATATAAATATTACTTCATGCGTGACTTAATTTTTAAAAAAATTTCATAAAATTTTTAAATAAGACGGACGGTTAAACGTTGGACACGGAAAC 1 1 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR812 3e-67 osa-MIR812a 7e-25 -59.9 (((((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((...........((((((..((....))..))))))..((((.((((..(((....)))..)))).))))............))))))))))))))))))))))))))))).))))).))).))))) (-59.90)