mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGGATGATTAAAGTTGGACACGG TGTCTAACTTTGATCGTCCGTTT CATGAGTTTTGTGTCTAACTTTGATCGTCCGTTTTATTTTAAATTTTTTATGATTAATATTTTTATTGTTATTAGATTATAAAACACAAATAGTACTTTATGTGTGACTTATGTTCTTTAGTTTTTTCAAAAAAAATTAAATAAAACGGATGATTAAAGTTGGACACGGAAATTCATGG 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR812 6e-32 osa-MIR812j 0.00000000001 -65.7 (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.(((.(((((....))))).....(((.(((((..((((.((((....)))).))))..))))).))).........))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))). (-65.70)