mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATATGTTTGTACAAGCTTT AGCTGTAGCGTTATTCCAG CTGCTTTGTGAATATGTTTGTACAAGCTTTACAAAGCTGTAGCGTTATTCCAGAGCAGTT 2 5 5' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR2099 2e-28 -21.8 ((((((((.((((((((...((((.((((....))))))))))).))))))))))))).. (-21.80)