mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATGTTTACAAGTTAAAATGT GATTTAACTCAAGTGAGCATTGTGC TCTTATCTCACATGTTTACAAGTTAAAATGTGGAGCAGAGGGTATACAACCCAAACAAGTTTGGCACTCTGAACGATTTAACTCAAGTGAGCATTGTGCGAGGCCAT 2 3 5' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR2101 4e-56 -29.1 .....((.(((((((((((.(((((((.(((....(((((.(....)...(((((....)))))..))))).))).)))))))...))))))).)))).))...... (-29.10)