mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGTGGAATCCCTTTGGAAT TCCAAAGGGATCGCATTGATC TATATATCGGCCTGAGGAAACTAGTGGAGGACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGGGTAGCTATCTCGATCGATCGCCTCATCGATCGACGACGACGTGCGTGATCGATCAGTGGAATCCCTTTGGAATTTTCCTCTTGCTTCCGCCTCTCATCTTCC GACTATACACTTAGCTTAGTGTTTACCTAGCTAGCTTGCAGCTGGCTGCAACAAACATTCTGGATGGACTTTGAATTCTAGAGATTGGAGAGTTAATTAGATAGCTTAGCTACCACAATGCATGCGTGCAACCTGATAGCTTAGCTACGCGTAGTTGCCAATTCAACCGGGCGACATATATATCGGCCTGAGGAAACTAGTGGAGGACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGGGTAGCTATCTCGATCGATCGCCTCATCGATCGACGACGACGTGCGTGATCGATCAGTGGAATCCCTTTGGAATTTTCCTCTTGCTTCCGCCTCTCATCTTCCTTGATCGATCGATCCTTTGCCTGCTGGACGCGCTTGCCTGCCGGCTTGCTTCTTCCATCGCCGCCTGATCAATCCGCAAGCTGCTCAGATTCAGGAGTTAATCGAAGCCAACGCTAGCACACAGGT 3 0 3' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR393b 4e-66 -53.2 ........(((..((((.....((.((((((.(((((((((((..((((((((.((...((..(((((.(((((((......)))))))))).))...))....))))))))))..))))))))))).)))))).))..)))).)))........... (-53.2)