mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCG GCAAGTTGTCCTTGGCT CAGCCAAGGATGACTTGCCGGTACGTGTATGCATGTTTCAAGGTACTATATGTGCCCCCAACTGTTTTAGATCCATGCTGACATTTTCCGGCAAGTTGTCCTTGGCT 3 0 5' arm Oryza_sativa micropc MIR169_2 7e-55 osa-MIR169b 4e-56 -55.5 .(((((((((..(((((((((...((((..(((((..((..(((((.....)))))..(....).....))..)))))..))))...)))))))))..))))))))) (-55.50)