mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCAC GATGTTGGCATGGTTCAATC GATGTTGGCATGGTTCAATCAAACCGGGCAAACTTATGCACTAGCTAAGCAAGATGCAGGGATATGCAGTATGGTTTTGTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCAC 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 4e-56 osa-MIR171f 3e-57 -56.4 (((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((....((...))....((((......)))))))))).)))))))))).))))))))))))))))))))).. (-56.40)