mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCCT GGGAATGTTGTCTGGCTCGAGG AGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCATGGAGAAACCTCTGATCGATCAGGTTTGATCTGTAGAGACTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCT 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc mir-166 9e-48 osa-MIR166d 5e-49 -44 (((((((((..((((((..((((((.((.((((....))))((((((......)))))).........))))))))..))))))..))))))))) (-44.00)