mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATC TGTTGGCTCGGCTCACTC GATGTTGGCTCGGCTCACTCAGACGGCATTGGCGTGATGCAAAGCATGCATGCGTGCTTGCTACCTCACTTGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 9e-48 osa-MIR171e 5e-49 -52.4 (((((((((.(((((((.(((((.(((((....((((.((((.(((((....)))))))))....))))..)))))))))).))))))).))))))))) (-52.40)