mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCC CGTGCGAGGAGCCAAGCA TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAAACTCAGTTGAAACAACTGCCTTCTCCCGGCGAGATTCAGGCATTGTGTTCGTACGTTTGGCTCTACTGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCA 3 0 5' arm Oryza_sativa micropc mir-160 2e-68 osa-MIR160d 9e-70 -68.1 .((.(((((((.(((((((((..(((((((..(((((((.....((((((((.(((((((((.....))))...))))))))).))))...))))))).)))).)))..))))))))).))))))).)). (-68.10)