mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC CAGGAAAGAGGCAGAGCATGG GCAGGAAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGATGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC 4 0 3' arm Lotus_japonicus micropc MIR408 9e-48 ptc-MIR408 0.0000000003 -51.3 .((((.(((((((((.(((((..((((((((.(((((((....(((..........))).)))))))))))))))..))))).))))))))).)))).. (-51.30)